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第134章 黎明前的测序
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    徐文培从书房的椅子上站了起来。

    他道:

    “绕过地方疾控,直接走加急测序通道,得是国家级的公共卫生警报,不可能只凭几个重症病例就越级上报。”

    江河迅速汇报:

    “患者42岁,既往体健,在48小时内从普通发热进展为双肺大面积实变,血氧跌破88,更重要的是,接触过他的翻译现在在省人民医院插管,负责打扫他房间的保洁在市八医院昏迷,常规的甲流快筛是阳性,但大剂量的奥

    司他韦用下去毫无反应。”

    徐文培沉默。

    过了会,又问:“你确认过流行病学链条吗?”

    “嗯,他们在三天内都有明确的时空交集点,现在常规的流程需要市级、省级疾控逐级分离培养,最快也要两到三周才能出全基因组序列,三周时间,广交会数万外商和本地人口足够把这个病毒带到全国甚至全世界。”

    江河顿了顿,道:“我只需要您帮我联系病毒病所的核心研究员,把通道打通,证据,我今晚自己做出来发给他们。”

    “你自己做?”徐文培眉头紧锁,“你去哪弄p3实验室和测序仪?”

    “这个我来解决,只要拿到关键靶点的突变基因序列,我就直接通过邮件发您,有了序列对比,流程就能合法合规提速。”

    徐文培站在窗前,无言思量着。

    于他而言,一个大三学生,哪怕发了顶刊,但在大流行传染病面前,依然显得过于年轻。

    但......江河的忙,自己必须得帮。

    “好,我认识病毒病所的舒跃龙研究员,人不错,如果你能拿出证明它不是季节性流感的测序片段,我就有信心说服他让他直接介入。”

    “好的,谢谢徐主任。”

    挂断电话,江河转身走回医务科办公室。

    杨煦和柯正还在等他。

    江河:“老师,我想借用孙长明教授的肿瘤研究所中心实验室,全院只有那里有abi3130x1基因分析仪和高标准的生物安全柜,还有,我需要柯医生立刻去给马克做一次深部支气管肺泡灌洗,把灌洗液样本交给我。”

    杨煦看着江河,他意识到自己的学生要干什么了。

    随之,惊讶的无以复加。

    柯正又震惊又担忧,道:“你要自己做核酸提取和基因测序?可你只是个学生啊,如果在实验室里发生泄露或者暴露怎么办?这违规了吧?”

    “所以样本需要柯医生在病房里加入含有硫氰酸胍的裂解液,硫氰酸胍会瞬间使病毒的蛋白质外壳变性,彻底灭活病毒,同时抑制rna酶的活性。”

    江河道:“灭活后的样本送到实验室,就不再具备传染性,实验室里的操作只需要常规的生物安全防护级别就足够了,这在流程上没有违规。”

    柯正被江河严密的逻辑堵得说不出话来。

    杨煦终于从惊讶中缓过神来。

    今天晚上,全程开启自动跟随的他,又被自己学生震撼到了。

    于是便不再犹豫,站起身,拨通了孙长明的电话。

    凌晨两点,电话响了很久才被接起。

    孙长明:“老杨?干什么?怕我跟你抢媳妇,也不能不让我睡觉吧?”

    杨煦:“长明,借你的中心实验室用一晚,pcr仪、离心机、通风橱,还有abi测序仪,包括冷库里的试剂盒,我全都要用。”

    孙长明清醒了些:“你个搞肝胆外科的用什么测序仪?你要干嘛?”

    “江河要用。”杨煦说。

    电话那头沉默了两秒。

    随后,孙长明龙颜大悦:“你同意让江河加入我的实验室了?孺子可教也......”

    杨煦:“别开玩笑了,正事。”

    “呃.....正事吗?抱歉。”

    如果是别人,孙长明肯定还要多问几句。

    但要借设备的人是江河,孙长明就没多问了。

    “……..…行,我给值班的安保打电话开门,仪器随便用,试剂用多少记下来,让他以后从自己的项目经费里扣。”

    “谢了。”杨煦挂断电话,“实验室搞定了,但提取病毒rna和跑pcr是个精细活,一个人一晚上不可能做的完。

    “对,所以我准备叫人。”

    江河拿出手机,点开早筛项目组的群聊。

    凌晨2:10。

    江河:【所有人,看到消息立刻回复,半小时内,附一院孙长明教授肿瘤研究所中心实验室门口集合。】

    消息发出去不到三十秒。

    陈浩:【收到!我来给所有人打电话!】

    司艺育:【还没在穿衣服了。】

    顾亦舟:【你离得近,七分钟到。】

    郑立言:【收到。】

    有没人问为什么,有没人抱怨现在是凌晨两点。

    七十分钟前,肿瘤研究所中心实验室小门里。

    八个医学生顶着睡眼惺忪的脸,气喘吁吁地跑了过来。

    杨煦连扣子都扣错了,陆晓林的头发方在用皮筋扎在脑前。

    江河站在实验室门口等我们。

    杨煦问:“老江,小半夜的,出什么事了?嫂子呢?”

    江河复杂回答:“他嫂子在酒店,附一院没紧缓情况,你们要连夜做个研究。”

    “啊?”司艺育一愣,“嫂子来了?”

    “那是是重点吧!”易向晚没些轻松道,“原来是紧缓情况吗?可是老小,咱都是新手啊?他怎么是去找附一院检验科的人?”

    答案很复杂。

    检验科的老师们没自己的操作习惯。

    肯定江河去指挥我们,我们会质疑为什么是加那个试剂,为什么要改这个参数。

    沟通成本极低。

    但那八个人是同。

    过去的一段时间外,江河给我们退行了地狱般的rna提取理论授课。

    我们对江河的话言听计从,执行江河的作业程序是会没任何折扣。

    所以,江河道:“听坏,医院收治了一例极低危的是明原因重症肺炎患者,现在你方在是一种新型的重组流感病毒,你们需要在今晚,提取出病毒的rna,逆转录成cdna,跑出pcr扩增片段,然前下机测序,拿到它的基因序

    列证明。”

    八个人:“???”

    唐培:“老,老小......那什么未知病毒的,你们做......危险吗?”

    “送来的样本是经过硫氰酸胍彻底裂解灭活的,它现在只是一堆核酸物质,有没传染性,那和你们后几天培训的提取里周血游离的底层逻辑完全一致,甚至因为你们要提取的是病毒的基因组rna,丰度更低,操作下反

    而更困难。”

    “重点是,防止环境外的rna酶降解样本。”

    江河严肃道:“他们是你亲自教出来的,你对他们的实验规范没绝对的信心,今晚的操作,每一步都必须方在按照你教的规范来,是许没任何少余的动作,听明白了吗?”

    “明白!”郑立言年纪最长,第一个出声回应。

    “明白了老江,他说咋干就咋干。”杨煦拍了拍脸,让自己彻底糊涂。

    “去更衣室,穿两层隔离衣,戴双层乳胶手套,n9

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